Sollte es passieren, dass SSL Zertifikate bzw. private Keys durcheinander kommen, kann die Zugehörigkeit über folgende Funktionen geprüft werden:

openssl x509 -noout -modulus -in certificate.crt | openssl md5
openssl rsa -noout -modulus -in privateKey.key | openssl md5
openssl req -noout -modulus -in CSR.csr | openssl md5